納莉颱風於90年9月16至19日侵台，其貫穿的特殊路徑所致，多處單日降雨量刷新歷史紀錄。颱風並造成北市捷運及臺鐵臺北車站淹水；近165萬戶停電；逾175萬戶停水。期間計94人死亡、10人失蹤；損失近8億元；工商部分損失超過40億元；農林漁牧損失約42億元。

納莉颱風於90年9月6日11時台灣東北方海域生成，中央氣象局隨即發布海上颱風警報。10日納莉颱風東移至琉球那霸近海，於13日再次調頭緩慢接近台灣。隨後於15日2時轉撲台灣東北部，並增為中度颱風。中央氣象局隨即發布海上陸上颱風警報，終在16日21時40分登陸三貂角至頭城一帶，歷經49小時肆虐後，才由台南安平進入台灣海峽南部。中央氣象局於19日17時解除陸上颱風警報，後於23時解除海上颱風警報。

此次累積最大降雨出現在苗栗縣泰安鄉的馬達拉（苗栗縣泰安鄉）為1,545.5mm；超過1,000mm以上區域主要在苗栗縣泰安鄉、南庄鄉、新竹縣五峰鄉、尖石鄉及台中縣和平鄉。

台北市基隆河多處堤防缺口未補，造成颱風時爆滿的基隆河水在突破警戒水位後，由堤防缺口灌入台北市，使大台北地區嚴重水患。並造成台北捷運板南線、台北車站等地下鐵路遭水淹沒，以及忠孝東路淹水，使台北交通陷入混亂。

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台北市邀學者專家成立納莉颱風災後重建委員會，提出多項關鍵性具體建議，包括：

1.儘速設置市級災害防救專責機構與區級專責人員。

2.短期內進行災害分級，確立緊急應變中心應變事項之運作及操作流程。

3.建立防救資料庫與資訊系統，整合災情搜集與傳遞系統。

4.強化危機意識，推動防災教育。

5.以總合治水理念處理防洪排水問題。

6.限期完成未達保護標準的部份堤防。

7.儘速解決基隆河圓山瓶頸河段問題。

8.捷運應逐步恢復行控中心的原有功能，

9.受創嚴重的台北車站等捷運各站，應成立安檢委員會，監督測試與驗證安全工作。

10.建請捷運公司嚴謹評估在地面上適當地點設置第二行控中心的可行性。

11.捷運短期內檢討應變程序，明年防汛期前完成中期改善方案。

12.坡地防災組也作出迅速處理危險聚落、危險溪流、坡地安全等優先問題。

13.強烈建議暫緩開發利用保護區與山坡地。

14.動用公權力嚴格取締山坡地的非法與違章行為等。

一、救災首應建立聯絡通訊管道

二、將捷運行控中心移設較高位置

三、各廠、站之沙包儲存量應充足

四、防洪標準的表達需容易瞭解

五、水文重現期距分析依據歷史資訊

六、台北地區需嚴防突發性豪大雨

七、颱風期間各項資料應妥善處理

時間(年/月日/時分)	概述
90/0908/2350	中央氣象局針對納莉颱風來襲發布第一次海上颱風警報。
90/0910/0900	中央氣象局針對納莉颱風來襲解除第一次海上颱風警報。
90/0913/1500	中央氣象局針對納莉颱風來襲發布第二次海上颱風警報。
90/0915/0245	中央氣象局針對納莉颱風來襲發布陸上颱風警報。
90/0916/2200	南湖抽水站當機，人員撤守，內湖地區淹水兩層樓。
90/0916/2300	景美溪右岸因水位上漲，開始溢流，木柵路地區淹水及腰。
90/0917/0130	磺溪河水暴漲，洪水溢出堤防。
90/0917/0700	大水淹進捷運昆陽站，並隨著行車軌一路蔓延。
90/0917/0800	玉成抽水站回報洪水淹沒機具，水淹進松山並進而淹至地下運輸網路；台北捷運行控中心宣布捷運全部路網停止。
90/0917/0910	台北車站站前廣場上方施工工地，發生大量洪水灌進台北車站，板南線月台與軌道積水，水沿板南線軌道向東西蔓延。
90/0917/1000	台北捷運忠孝復興站遭來自忠孝東路崇光百貨地下室流入之洪水淹沒，至此板南線台北車站以東路段全遭水淹。
90/0917/1300	台北捷運西門站第三四月台下行軌進水；同時間台鐵松山車站淹水，大水從地下鐵軌進入，並向西蔓延。
90/0919/1710	中央氣象局針對納莉颱風來襲解除陸上颱風警報。
90/0919/2305	中央氣象局針對納莉颱風來襲解除第二次海上颱風警報。

0612豪雨事件發生期間，位於主要降雨影響區域內之水庫， 僅有曾文水庫有調節性放水，其調節性洩洪時間從 6月15日上午8時起至6月17日下午5時止，調節性洩洪流量為 300立方公尺/秒~1,500立方公尺/秒(6月15日下午11時)，調節性洩洪前後水位及蓄水量在調節性洩洪前為水位225.77公尺，有效蓄水容量為58,697萬立方公尺；調節性洩洪後為水位226.20公尺，有效蓄水容量為59,465萬立方公尺。

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